2006年11月18日，中科合成油工程有限公司在北京市海淀区清华科技园玉泉慧谷正式宣布成立。国家发改委能源局吴吟副局长、国家科技部石定寰先生、国家能源领导小组李豪峰处长、中国科学院高技术局阴和俊局长、陈俊武院士、前机械部副部长赵明生、伍宏业设计大师、山西煤化所孙予罕所长、海军后勤部陈同柱研究员，及能源行业协会和该领域的有关领导和专家出席了庆典仪式并作了讲话。煤制油技术研讨会与该公司成立仪式同期举行。

      中科合成油工程有限公司是中科合成油技术有限公司的全资子公司，工程公司的成立将逐步完善“煤转油”技术的支撑体系。公司李永旺董事长在庆典仪式上介绍说：“目前，建设百万吨级的煤基间接合成油生产系统的核心技术已经掌握，但是国家在工程化方面还缺乏重要的二次开发的环节，影响到技术工程化的质量，新建的中科合成油工程公司即起到了优化这一环节的作用。”

      2001年启动的浆态床铁基催化剂煤基合成油项目，经过几年的中间试验，形成了我国完全拥有自主知识产权的成套技术。为了支持合成油产业建设，以中科院山西煤化所的研发团队和装备为基础，2006年4月成立了中科合成油技术有限公司，是山西煤化所联合产业界加速煤基合成油技术成果转化迈出的重要一步。为了配合煤制油工程的建设和煤制油产业发展的需要，于2006年9月在北京注册成立中科合成油工程有限公司。工程公司将为用户提供煤制油工程的设计、监理、总承包、咨询等主要业务，从而进一步提高技术工程化的质量。中科合成油技术有限公司和工程有限公司将形成拥有先进技术和具备强大技术原创能力的国际一流的技术开发单元，成为保障能源化工这一国家最大的支柱产业良性运转的技术原动力。